第一批台商包機從武漢回台，卻傳出機上人員並非我國要求的弱勢優先名單，甚至被塞了一名感染確診病患；蔡英文總統表示，現階段處理下一次包機，要以弱勢優先、檢疫優先原則，並強調「疫病處理和人民生命是最優先考量，沒有政治考量」。

中方主導名單 違反雙方處理原則和修先順序
蔡英文上午到疾病管制署視察、並替防疫人員加油打氣，指出抗疫工作是持續的、要先照顧好自己的健康，才能照顧別人；之後她面對媒體受訪時被問到台商包機一事，她指出，之前有和對方（指中國）溝通處理原則和優先順序，對方也同意配合，但之後發現名單是由中國方面主導的名單。

蔡英文說，這沒有符合雙方說好的順序，一方面是弱勢者沒有搭上第一批，讓他們處在困難的情況，另一方面也對檢疫造成困擾，也希望之後要處理下一次包機要確認弱勢優先、檢疫優先原則。

對於中國國台辦另外給予了新的800多名要包機回台的名單，蔡英文說，目前都仍在持續溝通階段，基本原則和初心不變。